根據<美聯社>(AP)報道﹕幾十年來，印度尼西亞的伊斯蘭運動在蘇哈托的鐵拳下沒有發展的機會，蘇哈托說，他要建立一個西方式“民主”社會。蘇哈托倒臺後，伊斯蘭運動抬頭，美國擔心，印尼未來的民主運動將受到威脅。伊斯蘭運動的特征之一是穆斯林民間的自發熱情，但是本拉登領導的凱伊達組織利用印尼政府寬松的機遇滲透到了印度尼西亞民間社會，這是世界上人口最多的穆斯林國家。美國國防部副部長､前駐印尼大使，保羅•沃弗維茲對印尼Tempo雜誌社記者說﹕“我誠實地認為，他們對印尼的危害要比對美國危害更大。”

伊斯蘭激進勢力在40和50年代反對建立世俗化政府遭到血腥鎮壓﹔在印尼國家軍事博物館中，專有一個大展廳，陳列當年的鬥爭慘烈狀況，告誡人們提防伊斯蘭運動再次興起。展品中包括一些圖片，表現纏著頭巾的伊斯蘭好鬥分子在農村裡屠殺婦女和兒童的情景。還有一些圖片顯示印尼官兵在刑場上射殺極端分子。以美國為首的西方國家為印尼設定了西方式民主體制，最擔心的就是新一輪伊斯蘭武裝起義，奪取政權。蘇哈托的32年殘暴統治因為鎮壓伊斯蘭運動有功，西方國家對他的暴行一律默許，1998年蘇哈托倒臺，他的那些強硬的武裝部隊忽然變得群龍無首，放松對伊斯蘭運動的監控，使伊斯蘭復興獲得可乘之機，如同野火春風在全國各地興旺起來。

此外，印尼社會經歷了連續四年的經濟衰落，使60%的民眾落入貧困的深淵，城市裡到處有數以百萬失業大軍，這些人成了伊斯蘭極端集團的物色對象。印尼伊斯蘭學者委員會的一位官員迪恩•薩姆蘇丁說﹕“由於經濟危機，許多人加入到武裝團體中來。社會上出現的經濟和政治的不公正，是產生伊斯蘭武裝集團的根本原因。”

印尼社會在蘇哈托的高壓政策管制下，享受了幾十年的平靜，一億七千萬穆斯林與三千五百萬基督教､佛教和印度教信徒相安無事，誰也不敢挑起事端。蘇哈托下野，人口眾多的穆斯林涌上街頭，左右局勢，發生許多衝突。新興的伊斯蘭運動可能使整個東南亞不安寧，西方國家密切注意印尼的局勢和動態，隨時可能出兵干涉。(AP，USA，28/11/2001，伊光編譯)